«Сидеть на первой парте» или «за первой партой»: как говорить правильно

«Сидеть на парте» — значит усесться на столешницу сверху. А если речь идёт о сидении на стуле перед столом (как и предполагается на уроке), то тогда ученик сидит «за партой»: хоть за первой, хоть за последней.

Правильно: за первой партой

Теоретически предлог «на» по отношению к парте тоже можно применить — например, когда речь идёт о парте древней конструкции, состоящей из соединённого стола и скамейки. Но в настоящее время такие столы встречаются гораздо реже, чем отдельная пара из стола и стула.
Вариант «сидеть на задней парте» может быть таким устойчивым ещё и потому, что последние парты в классе иногда называют «галеркой» (так называется верхний, самый дальний ярус в театре или цирке). Зрители сидят «на галерке» — и, возможно, по аналогии с этим ученики сидят «на задней парте». Правда, такое объяснение всё равно не делает фразу с предлогом «на» правильной.